Идем в настройки модуля Поиск. Администрирование => Настройки => Настройки продукта => Настройки модулей => Поиск.

Переходим на вкладку Статистика и снимаем галочку с пункта Собирать статистику по поисковым фразам:

Готово, теперь в результатах поиска у ссылок не будет параметра sphrase_id.